■本館1階 「大洋の航海者」：ドーナツ型2,200 t水槽
クロマグロ、キハダ、ハガツオ、スマ、カツオ、コシナガなど |
■本館1階 「世界の海」
太平洋、インド洋、大西洋、カリブ海、深海、北極海・南極海 |
■本館1階 「渚の生物」
アカエイ、ネコザメ、マダコ、アメフラシ、タッチングプール（ヒトデ、ウニなど） |
■本館1階 「ペンギンの生態」
フンボルトペンギン、イワトビペンギン、フェアリーペンギンの屋外飼育 |
| ■本館1階 「海藻の林」 ジャイアントケルプなど |
| ■本館1階 「東京の海」 小笠原、伊豆七島、東京湾 |
| ■本館1階 「海鳥の生態」 ウミガラス、エトピリカなど |
■本館2階 「大洋の航海者」
アカシュモクザメ、ツマグロなどのサメ類、エイ類、マイワシの群 |
| ■淡水生物館 オイカワ、イワナ、ヤマメ、メダカなど日本の淡水生物 |
